High-throughput sequencing and vaccine design.

Les technologies de séquençage de nouvelle génération (SNG) ont donné une impulsion nouvelle à la recherche sur le génome. Le niveau accru de profondeur et de résolution de séquençage qui en résulte se traduit par une précision génomique inégalée, ce qui à son tour donne lieu à une meilleure perception de la complexité des génomes animaux et humains et de ceux des agents pathogènes. Cela a également ouvert de nouvelles perspectives à la recherche sur les vaccins. D’une part, la complexité accrue du génome nous invite à étudier et à mieux comprendre la biologie des agents pathogènes et les interactions entre ceux-ci et leurs hôtes. D’autre part, les données de plus en plus nombreuses sur le génome permettent d’obtenir des informations cruciales pour mettre au point et concevoir de meilleurs vaccins contre certains agents pathogènes précédemment difficiles à traiter, par exemple les bactéries ou les virus à ARN soumis à des mutations rapides et présentant des interactions complexes avec le système immunitaire de l’hôte. Cette synthèse décrit l’impact des nombreuses applications des technologies de séquençage de nouvelle génération sur la recherche sur les vaccins, en particulier les conséquences dans le domaine de la génomique virale et les travaux récents de virologie humaine et vétérinaire.

Las técnicas de secuenciación de próxima generación han transformado la investigación sobre el genoma. El incremento de la profundidad y la resolución de la secuenciación que estas técnicas han hecho posible ha servido para conocer el genoma con un nivel de detalle sin precedentes y para tomar cada vez más conciencia de la complejidad que reviste el genoma de animales, seres humanos y patógenos. Ello, a su vez, ha traído consigo nuevos métodos de investigación en materia de vacunas. Por un lado, la creciente complejidad que observamos en el genoma pone a prueba nuestra capacidad para estudiar y entender la biología de los patógenos y las interacciones entre patógeno y anfitrión. Por otro lado, del creciente volumen de datos genómicos podemos extraer información básica para concebir y obtener vacunas más eficaces contra patógenos que hasta ahora eran muy difíciles de combatir, como virus ARN o bacterias que mutan con gran rapidez e interaccionan de forma compleja con el sistema inmunitario del anfitrión. El autor explica cómo está influyendo en la investigación sobre vacunas el uso generalizado de técnicas de secuenciación de próxima generación para estudiar e investigar el genoma, centrándose especialmente en las repercusiones que de ahí se siguen en el ámbito de la genómica vírica y refiriéndose a una serie de recientes estudios realizados en animales y personas.

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